Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S3

SEC61A2, Protein transport protein Sec61 subunit alpha isoform 2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC61A2Q9H9S3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC61A2Q9H9S3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC61A2Q9H9S3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC61A2Q9H9S3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SEC61A2Q9H9S3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SEC61A2Q9H9S3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SEC61A2Q9H9S3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SEC61A2Q9H9S3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SEC61A2Q9H9S3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC61A2Q9H9S3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEC61A2Q9H9S3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEC61A2Q9H9S3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms