Protein–RNA interactions for Protein: Q9H981

ACTR8, Actin-related protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR8Q9H981 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ACTR8Q9H981 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ACTR8Q9H981 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACTR8Q9H981 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACTR8Q9H981 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
ACTR8Q9H981 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACTR8Q9H981 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms