Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6H4

REEP4, Receptor expression-enhancing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP4Q9H6H4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
REEP4Q9H6H4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
REEP4Q9H6H4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
REEP4Q9H6H4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
REEP4Q9H6H4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
REEP4Q9H6H4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
REEP4Q9H6H4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP4Q9H6H4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
REEP4Q9H6H4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms