Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2X6

HIPK2, Homeodomain-interacting protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK2Q9H2X6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HIPK2Q9H2X6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HIPK2Q9H2X6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIPK2Q9H2X6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIPK2Q9H2X6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HIPK2Q9H2X6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HIPK2Q9H2X6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIPK2Q9H2X6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HIPK2Q9H2X6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HIPK2Q9H2X6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HIPK2Q9H2X6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HIPK2Q9H2X6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HIPK2Q9H2X6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HIPK2Q9H2X6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms