Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHLHE41Q9C0J9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BHLHE41Q9C0J9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BHLHE41Q9C0J9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BHLHE41Q9C0J9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BHLHE41Q9C0J9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHLHE41Q9C0J9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BHLHE41Q9C0J9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BHLHE41Q9C0J9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHLHE41Q9C0J9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHLHE41Q9C0J9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHLHE41Q9C0J9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms