Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SOX7Q9BT81 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
SOX7Q9BT81 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOX7Q9BT81 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SOX7Q9BT81 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SOX7Q9BT81 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SOX7Q9BT81 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms