Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOX7Q9BT81 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOX7Q9BT81 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX7Q9BT81 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SOX7Q9BT81 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SOX7Q9BT81 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX7Q9BT81 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX7Q9BT81 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX7Q9BT81 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SOX7Q9BT81 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOX7Q9BT81 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SOX7Q9BT81 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SOX7Q9BT81 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SOX7Q9BT81 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOX7Q9BT81 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SOX7Q9BT81 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SOX7Q9BT81 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOX7Q9BT81 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOX7Q9BT81 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOX7Q9BT81 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOX7Q9BT81 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SOX7Q9BT81 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SOX7Q9BT81 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SOX7Q9BT81 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SOX7Q9BT81 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SOX7Q9BT81 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SOX7Q9BT81 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SOX7Q9BT81 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SOX7Q9BT81 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SOX7Q9BT81 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SOX7Q9BT81 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SOX7Q9BT81 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SOX7Q9BT81 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SOX7Q9BT81 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SOX7Q9BT81 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SOX7Q9BT81 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX7Q9BT81 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SOX7Q9BT81 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX7Q9BT81 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SOX7Q9BT81 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SOX7Q9BT81 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SOX7Q9BT81 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SOX7Q9BT81 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX7Q9BT81 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SOX7Q9BT81 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SOX7Q9BT81 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SOX7Q9BT81 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SOX7Q9BT81 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX7Q9BT81 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX7Q9BT81 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SOX7Q9BT81 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SOX7Q9BT81 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX7Q9BT81 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX7Q9BT81 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SOX7Q9BT81 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SOX7Q9BT81 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SOX7Q9BT81 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SOX7Q9BT81 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SOX7Q9BT81 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SOX7Q9BT81 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SOX7Q9BT81 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SOX7Q9BT81 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SOX7Q9BT81 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SOX7Q9BT81 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX7Q9BT81 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SOX7Q9BT81 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SOX7Q9BT81 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX7Q9BT81 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SOX7Q9BT81 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX7Q9BT81 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SOX7Q9BT81 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX7Q9BT81 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX7Q9BT81 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX7Q9BT81 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX7Q9BT81 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX7Q9BT81 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX7Q9BT81 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX7Q9BT81 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX7Q9BT81 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX7Q9BT81 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX7Q9BT81 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX7Q9BT81 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX7Q9BT81 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX7Q9BT81 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX7Q9BT81 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX7Q9BT81 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX7Q9BT81 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX7Q9BT81 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX7Q9BT81 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SOX7Q9BT81 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX7Q9BT81 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SOX7Q9BT81 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SOX7Q9BT81 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SOX7Q9BT81 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX7Q9BT81 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SOX7Q9BT81 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SOX7Q9BT81 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SOX7Q9BT81 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SOX7Q9BT81 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SOX7Q9BT81 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.5 ms