Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TSPAN17Q96FV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSPAN17Q96FV3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSPAN17Q96FV3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN17Q96FV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPAN17Q96FV3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN17Q96FV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN17Q96FV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSPAN17Q96FV3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms