Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MTERF3Q96E29 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTERF3Q96E29 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTERF3Q96E29 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MTERF3Q96E29 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MTERF3Q96E29 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MTERF3Q96E29 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MTERF3Q96E29 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms