Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
VN1R17PQ8TDU5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
VN1R17PQ8TDU5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
VN1R17PQ8TDU5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
VN1R17PQ8TDU5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VN1R17PQ8TDU5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VN1R17PQ8TDU5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms