Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAG5

VSTM2A, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2AQ8TAG5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM2AQ8TAG5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VSTM2AQ8TAG5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VSTM2AQ8TAG5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
VSTM2AQ8TAG5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
VSTM2AQ8TAG5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
VSTM2AQ8TAG5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VSTM2AQ8TAG5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms