Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD2

ANKK1, Ankyrin repeat and protein kinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKK1Q8NFD2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKK1Q8NFD2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ANKK1Q8NFD2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ANKK1Q8NFD2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKK1Q8NFD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKK1Q8NFD2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ANKK1Q8NFD2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ANKK1Q8NFD2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ANKK1Q8NFD2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ANKK1Q8NFD2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ANKK1Q8NFD2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ANKK1Q8NFD2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ANKK1Q8NFD2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKK1Q8NFD2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKK1Q8NFD2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKK1Q8NFD2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ANKK1Q8NFD2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKK1Q8NFD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKK1Q8NFD2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKK1Q8NFD2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ANKK1Q8NFD2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ANKK1Q8NFD2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms