Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK2A3Q8NEV1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSNK2A3Q8NEV1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CSNK2A3Q8NEV1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CSNK2A3Q8NEV1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CSNK2A3Q8NEV1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms