Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EHBP1Q8NDI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EHBP1Q8NDI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EHBP1Q8NDI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EHBP1Q8NDI1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EHBP1Q8NDI1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EHBP1Q8NDI1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
EHBP1Q8NDI1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms