Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUE6

HIST2H2AB, Histone H2A type 2-B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ABQ8IUE6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HIST2H2ABQ8IUE6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HIST2H2ABQ8IUE6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HIST2H2ABQ8IUE6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HIST2H2ABQ8IUE6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HIST2H2ABQ8IUE6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HIST2H2ABQ8IUE6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms