Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT16

SLC18B1, MFS-type transporter SLC18B1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18B1Q6NT16 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC18B1Q6NT16 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC18B1Q6NT16 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC18B1Q6NT16 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC18B1Q6NT16 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SLC18B1Q6NT16 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SLC18B1Q6NT16 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SLC18B1Q6NT16 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC18B1Q6NT16 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms