Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ODF2Q5BJF6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ODF2Q5BJF6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ODF2Q5BJF6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ODF2Q5BJF6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ODF2Q5BJF6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ODF2Q5BJF6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ODF2Q5BJF6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ODF2Q5BJF6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
ODF2Q5BJF6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ODF2Q5BJF6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ODF2Q5BJF6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ODF2Q5BJF6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ODF2Q5BJF6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ODF2Q5BJF6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms