Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACKR1Q16570 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ACKR1Q16570 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACKR1Q16570 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ACKR1Q16570 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACKR1Q16570 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
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