Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
HDAC1Q13547 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
HDAC1Q13547 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HDAC1Q13547 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
HDAC1Q13547 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.42■■■□□ 2.94
HDAC1Q13547 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
HDAC1Q13547 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
HDAC1Q13547 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
HDAC1Q13547 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
HDAC1Q13547 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
HDAC1Q13547 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
HDAC1Q13547 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
HDAC1Q13547 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
HDAC1Q13547 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
HDAC1Q13547 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
HDAC1Q13547 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
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