Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LMNB2Q03252 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LMNB2Q03252 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LMNB2Q03252 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB2Q03252 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB2Q03252 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LMNB2Q03252 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LMNB2Q03252 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LMNB2Q03252 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LMNB2Q03252 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LMNB2Q03252 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LMNB2Q03252 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LMNB2Q03252 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNB2Q03252 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB2Q03252 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms