Protein–RNA interactions for Protein: Q03252

LMNB2, Lamin-B2, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB2Q03252 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
LMNB2Q03252 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LMNB2Q03252 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LMNB2Q03252 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
LMNB2Q03252 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
LMNB2Q03252 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
LMNB2Q03252 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
LMNB2Q03252 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
LMNB2Q03252 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.67■■■□□ 2.98
LMNB2Q03252 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
LMNB2Q03252 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMNB2Q03252 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMNB2Q03252 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMNB2Q03252 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
LMNB2Q03252 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMNB2Q03252 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMNB2Q03252 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMNB2Q03252 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMNB2Q03252 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
LMNB2Q03252 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
LMNB2Q03252 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
LMNB2Q03252 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LMNB2Q03252 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LMNB2Q03252 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
LMNB2Q03252 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
LMNB2Q03252 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMNB2Q03252 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
LMNB2Q03252 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
LMNB2Q03252 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
LMNB2Q03252 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
LMNB2Q03252 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
LMNB2Q03252 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
LMNB2Q03252 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
LMNB2Q03252 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
LMNB2Q03252 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
LMNB2Q03252 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.73
LMNB2Q03252 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
LMNB2Q03252 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
LMNB2Q03252 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
LMNB2Q03252 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
LMNB2Q03252 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
LMNB2Q03252 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
LMNB2Q03252 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMNB2Q03252 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
LMNB2Q03252 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
LMNB2Q03252 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
LMNB2Q03252 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
LMNB2Q03252 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
LMNB2Q03252 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
LMNB2Q03252 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
LMNB2Q03252 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
LMNB2Q03252 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
LMNB2Q03252 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
LMNB2Q03252 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
LMNB2Q03252 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
LMNB2Q03252 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
LMNB2Q03252 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
LMNB2Q03252 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
LMNB2Q03252 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
LMNB2Q03252 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
LMNB2Q03252 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
LMNB2Q03252 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
LMNB2Q03252 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
LMNB2Q03252 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
LMNB2Q03252 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
LMNB2Q03252 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
LMNB2Q03252 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
LMNB2Q03252 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
LMNB2Q03252 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LMNB2Q03252 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMNB2Q03252 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
LMNB2Q03252 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
LMNB2Q03252 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
LMNB2Q03252 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMNB2Q03252 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LMNB2Q03252 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LMNB2Q03252 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
LMNB2Q03252 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
LMNB2Q03252 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMNB2Q03252 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMNB2Q03252 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
LMNB2Q03252 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMNB2Q03252 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMNB2Q03252 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
LMNB2Q03252 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
LMNB2Q03252 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
LMNB2Q03252 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
LMNB2Q03252 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
LMNB2Q03252 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMNB2Q03252 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
LMNB2Q03252 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
LMNB2Q03252 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
LMNB2Q03252 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMNB2Q03252 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
LMNB2Q03252 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
LMNB2Q03252 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMNB2Q03252 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
LMNB2Q03252 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
LMNB2Q03252 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
LMNB2Q03252 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms