Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA6P60900 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMA6P60900 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA6P60900 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA6P60900 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PSMA6P60900 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PSMA6P60900 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PSMA6P60900 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms