Protein–RNA interactions for Protein: P48444

ARCN1, Coatomer subunit delta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCN1P48444 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ARCN1P48444 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
ARCN1P48444 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ARCN1P48444 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ARCN1P48444 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ARCN1P48444 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ARCN1P48444 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ARCN1P48444 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms