Protein–RNA interactions for Protein: P42677

RPS27, 40S ribosomal protein S27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27P42677 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPS27P42677 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS27P42677 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPS27P42677 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS27P42677 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS27P42677 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS27P42677 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS27P42677 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPS27P42677 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS27P42677 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPS27P42677 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27P42677 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPS27P42677 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27P42677 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPS27P42677 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS27P42677 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPS27P42677 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPS27P42677 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPS27P42677 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27P42677 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27P42677 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPS27P42677 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27P42677 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27P42677 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPS27P42677 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPS27P42677 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27P42677 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27P42677 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPS27P42677 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPS27P42677 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPS27P42677 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27P42677 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RPS27P42677 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RPS27P42677 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
RPS27P42677 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27P42677 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27P42677 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RPS27P42677 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27P42677 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RPS27P42677 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27P42677 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27P42677 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27P42677 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RPS27P42677 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27P42677 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27P42677 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RPS27P42677 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27P42677 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RPS27P42677 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RPS27P42677 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27P42677 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27P42677 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27P42677 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27P42677 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27P42677 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RPS27P42677 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RPS27P42677 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS27P42677 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RPS27P42677 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS27P42677 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RPS27P42677 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27P42677 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27P42677 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27P42677 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RPS27P42677 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27P42677 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27P42677 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RPS27P42677 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS27P42677 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS27P42677 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS27P42677 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RPS27P42677 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS27P42677 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RPS27P42677 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RPS27P42677 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RPS27P42677 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27P42677 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27P42677 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27P42677 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27P42677 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RPS27P42677 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27P42677 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27P42677 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27P42677 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27P42677 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27P42677 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27P42677 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RPS27P42677 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27P42677 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27P42677 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RPS27P42677 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27P42677 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27P42677 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RPS27P42677 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27P42677 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPS27P42677 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27P42677 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27P42677 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27P42677 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPS27P42677 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms