Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SOX11P35716 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX11P35716 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SOX11P35716 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX11P35716 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX11P35716 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SOX11P35716 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SOX11P35716 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
SOX11P35716 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX11P35716 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SOX11P35716 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX11P35716 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX11P35716 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX11P35716 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SOX11P35716 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX11P35716 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SOX11P35716 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX11P35716 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX11P35716 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SOX11P35716 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SOX11P35716 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX11P35716 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX11P35716 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SOX11P35716 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX11P35716 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SOX11P35716 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX11P35716 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX11P35716 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX11P35716 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX11P35716 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX11P35716 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX11P35716 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX11P35716 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX11P35716 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX11P35716 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX11P35716 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX11P35716 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX11P35716 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX11P35716 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX11P35716 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX11P35716 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX11P35716 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX11P35716 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX11P35716 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX11P35716 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX11P35716 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX11P35716 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX11P35716 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SOX11P35716 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX11P35716 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX11P35716 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX11P35716 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX11P35716 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX11P35716 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX11P35716 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX11P35716 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX11P35716 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX11P35716 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX11P35716 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX11P35716 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX11P35716 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX11P35716 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX11P35716 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX11P35716 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX11P35716 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX11P35716 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX11P35716 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX11P35716 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOX11P35716 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX11P35716 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX11P35716 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX11P35716 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX11P35716 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX11P35716 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX11P35716 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX11P35716 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX11P35716 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX11P35716 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX11P35716 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX11P35716 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX11P35716 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX11P35716 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX11P35716 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX11P35716 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX11P35716 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX11P35716 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX11P35716 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX11P35716 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX11P35716 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SOX11P35716 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX11P35716 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX11P35716 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX11P35716 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX11P35716 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SOX11P35716 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX11P35716 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SOX11P35716 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX11P35716 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX11P35716 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SOX11P35716 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms