Protein–RNA interactions for Protein: P35716

SOX11, Transcription factor SOX-11, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX11P35716 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SOX11P35716 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.85■■■□□ 2.69
SOX11P35716 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SOX11P35716 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SOX11P35716 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SOX11P35716 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SOX11P35716 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SOX11P35716 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
SOX11P35716 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SOX11P35716 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SOX11P35716 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
SOX11P35716 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
SOX11P35716 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SOX11P35716 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
SOX11P35716 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.4■■■□□ 2.46
SOX11P35716 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
SOX11P35716 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SOX11P35716 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SOX11P35716 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
SOX11P35716 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
SOX11P35716 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SOX11P35716 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SOX11P35716 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SOX11P35716 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SOX11P35716 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOX11P35716 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SOX11P35716 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SOX11P35716 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SOX11P35716 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SOX11P35716 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SOX11P35716 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SOX11P35716 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SOX11P35716 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SOX11P35716 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SOX11P35716 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SOX11P35716 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOX11P35716 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOX11P35716 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOX11P35716 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SOX11P35716 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SOX11P35716 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SOX11P35716 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SOX11P35716 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOX11P35716 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SOX11P35716 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SOX11P35716 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SOX11P35716 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX11P35716 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SOX11P35716 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX11P35716 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SOX11P35716 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX11P35716 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SOX11P35716 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX11P35716 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SOX11P35716 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SOX11P35716 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SOX11P35716 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SOX11P35716 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SOX11P35716 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SOX11P35716 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SOX11P35716 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX11P35716 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SOX11P35716 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SOX11P35716 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SOX11P35716 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SOX11P35716 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SOX11P35716 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SOX11P35716 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SOX11P35716 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SOX11P35716 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SOX11P35716 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SOX11P35716 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOX11P35716 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SOX11P35716 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SOX11P35716 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX11P35716 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX11P35716 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SOX11P35716 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SOX11P35716 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SOX11P35716 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SOX11P35716 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SOX11P35716 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SOX11P35716 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SOX11P35716 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SOX11P35716 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SOX11P35716 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SOX11P35716 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SOX11P35716 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOX11P35716 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SOX11P35716 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SOX11P35716 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SOX11P35716 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SOX11P35716 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX11P35716 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SOX11P35716 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SOX11P35716 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SOX11P35716 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SOX11P35716 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SOX11P35716 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SOX11P35716 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms