Protein–RNA interactions for Protein: P21246

PTN, Pleiotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTNP21246 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTNP21246 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTNP21246 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTNP21246 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTNP21246 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTNP21246 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTNP21246 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTNP21246 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTNP21246 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTNP21246 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTNP21246 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTNP21246 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTNP21246 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTNP21246 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTNP21246 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTNP21246 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTNP21246 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTNP21246 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTNP21246 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTNP21246 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTNP21246 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTNP21246 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTNP21246 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTNP21246 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTNP21246 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTNP21246 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTNP21246 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTNP21246 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTNP21246 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTNP21246 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTNP21246 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTNP21246 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTNP21246 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTNP21246 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTNP21246 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTNP21246 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTNP21246 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTNP21246 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PTNP21246 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTNP21246 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTNP21246 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTNP21246 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTNP21246 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTNP21246 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTNP21246 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTNP21246 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTNP21246 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PTNP21246 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTNP21246 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTNP21246 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTNP21246 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTNP21246 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTNP21246 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTNP21246 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTNP21246 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTNP21246 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTNP21246 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTNP21246 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTNP21246 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTNP21246 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTNP21246 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTNP21246 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTNP21246 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTNP21246 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTNP21246 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTNP21246 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTNP21246 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTNP21246 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTNP21246 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTNP21246 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTNP21246 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTNP21246 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTNP21246 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTNP21246 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTNP21246 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTNP21246 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTNP21246 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTNP21246 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTNP21246 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTNP21246 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTNP21246 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTNP21246 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTNP21246 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTNP21246 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTNP21246 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTNP21246 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTNP21246 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTNP21246 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTNP21246 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTNP21246 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTNP21246 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTNP21246 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTNP21246 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTNP21246 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTNP21246 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTNP21246 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTNP21246 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTNP21246 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTNP21246 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTNP21246 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms