Protein–RNA interactions for Protein: P19484

TFEB, Transcription factor EB, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFEBP19484 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TFEBP19484 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFEBP19484 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TFEBP19484 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFEBP19484 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFEBP19484 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TFEBP19484 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFEBP19484 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFEBP19484 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TFEBP19484 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TFEBP19484 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TFEBP19484 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TFEBP19484 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFEBP19484 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFEBP19484 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFEBP19484 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TFEBP19484 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFEBP19484 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFEBP19484 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFEBP19484 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFEBP19484 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFEBP19484 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TFEBP19484 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFEBP19484 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TFEBP19484 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TFEBP19484 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFEBP19484 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFEBP19484 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TFEBP19484 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TFEBP19484 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TFEBP19484 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TFEBP19484 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFEBP19484 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFEBP19484 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFEBP19484 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TFEBP19484 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFEBP19484 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TFEBP19484 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TFEBP19484 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TFEBP19484 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFEBP19484 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFEBP19484 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFEBP19484 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFEBP19484 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TFEBP19484 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFEBP19484 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFEBP19484 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TFEBP19484 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TFEBP19484 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFEBP19484 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFEBP19484 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFEBP19484 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFEBP19484 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFEBP19484 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFEBP19484 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFEBP19484 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFEBP19484 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFEBP19484 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFEBP19484 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFEBP19484 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFEBP19484 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFEBP19484 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFEBP19484 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TFEBP19484 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFEBP19484 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFEBP19484 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFEBP19484 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFEBP19484 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFEBP19484 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFEBP19484 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFEBP19484 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFEBP19484 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFEBP19484 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFEBP19484 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFEBP19484 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFEBP19484 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TFEBP19484 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
TFEBP19484 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFEBP19484 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFEBP19484 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFEBP19484 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFEBP19484 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFEBP19484 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFEBP19484 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFEBP19484 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFEBP19484 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFEBP19484 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFEBP19484 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFEBP19484 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFEBP19484 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFEBP19484 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFEBP19484 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFEBP19484 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFEBP19484 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFEBP19484 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFEBP19484 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFEBP19484 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFEBP19484 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFEBP19484 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFEBP19484 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms