Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
FGF3P11487 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGF3P11487 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FGF3P11487 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FGF3P11487 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGF3P11487 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGF3P11487 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGF3P11487 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGF3P11487 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGF3P11487 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGF3P11487 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FGF3P11487 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGF3P11487 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGF3P11487 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGF3P11487 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGF3P11487 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGF3P11487 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGF3P11487 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGF3P11487 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGF3P11487 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGF3P11487 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGF3P11487 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGF3P11487 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGF3P11487 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGF3P11487 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGF3P11487 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGF3P11487 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGF3P11487 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGF3P11487 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGF3P11487 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGF3P11487 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGF3P11487 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FGF3P11487 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGF3P11487 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGF3P11487 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FGF3P11487 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
FGF3P11487 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGF3P11487 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FGF3P11487 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FGF3P11487 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGF3P11487 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FGF3P11487 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGF3P11487 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGF3P11487 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FGF3P11487 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FGF3P11487 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FGF3P11487 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGF3P11487 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGF3P11487 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGF3P11487 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGF3P11487 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FGF3P11487 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FGF3P11487 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGF3P11487 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FGF3P11487 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGF3P11487 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGF3P11487 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FGF3P11487 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FGF3P11487 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGF3P11487 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGF3P11487 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGF3P11487 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGF3P11487 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGF3P11487 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FGF3P11487 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FGF3P11487 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FGF3P11487 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGF3P11487 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FGF3P11487 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FGF3P11487 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGF3P11487 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGF3P11487 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGF3P11487 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FGF3P11487 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FGF3P11487 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FGF3P11487 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF3P11487 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF3P11487 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF3P11487 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FGF3P11487 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FGF3P11487 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FGF3P11487 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGF3P11487 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGF3P11487 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FGF3P11487 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
FGF3P11487 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF3P11487 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF3P11487 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF3P11487 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF3P11487 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF3P11487 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF3P11487 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF3P11487 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FGF3P11487 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF3P11487 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF3P11487 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF3P11487 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF3P11487 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF3P11487 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FGF3P11487 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms