Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARAP10276 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARAP10276 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARAP10276 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARAP10276 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARAP10276 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARAP10276 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARAP10276 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARAP10276 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARAP10276 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RARAP10276 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARAP10276 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARAP10276 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARAP10276 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RARAP10276 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RARAP10276 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARAP10276 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARAP10276 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RARAP10276 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RARAP10276 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RARAP10276 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RARAP10276 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARAP10276 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARAP10276 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RARAP10276 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RARAP10276 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARAP10276 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARAP10276 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARAP10276 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARAP10276 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARAP10276 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARAP10276 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARAP10276 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARAP10276 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARAP10276 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARAP10276 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RARAP10276 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARAP10276 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARAP10276 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARAP10276 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARAP10276 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RARAP10276 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARAP10276 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARAP10276 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RARAP10276 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARAP10276 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RARAP10276 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARAP10276 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARAP10276 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARAP10276 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARAP10276 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARAP10276 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RARAP10276 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RARAP10276 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARAP10276 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARAP10276 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARAP10276 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARAP10276 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARAP10276 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RARAP10276 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
RARAP10276 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RARAP10276 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARAP10276 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARAP10276 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RARAP10276 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RARAP10276 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARAP10276 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RARAP10276 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RARAP10276 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RARAP10276 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RARAP10276 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RARAP10276 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RARAP10276 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RARAP10276 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARAP10276 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARAP10276 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARAP10276 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RARAP10276 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARAP10276 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARAP10276 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RARAP10276 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARAP10276 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARAP10276 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARAP10276 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARAP10276 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARAP10276 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RARAP10276 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RARAP10276 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARAP10276 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RARAP10276 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RARAP10276 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARAP10276 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RARAP10276 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARAP10276 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARAP10276 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RARAP10276 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RARAP10276 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARAP10276 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARAP10276 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RARAP10276 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms