Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SAA2P0DJI9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SAA2P0DJI9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAA2P0DJI9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SAA2P0DJI9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAA2P0DJI9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms