Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFPP02771 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
AFPP02771 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFPP02771 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFPP02771 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFPP02771 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
AFPP02771 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
AFPP02771 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFPP02771 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
AFPP02771 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFPP02771 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFPP02771 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFPP02771 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
AFPP02771 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
AFPP02771 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFPP02771 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFPP02771 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFPP02771 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
AFPP02771 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFPP02771 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFPP02771 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFPP02771 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFPP02771 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
AFPP02771 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
AFPP02771 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
AFPP02771 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFPP02771 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
AFPP02771 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
AFPP02771 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFPP02771 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFPP02771 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFPP02771 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
AFPP02771 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFPP02771 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFPP02771 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFPP02771 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFPP02771 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFPP02771 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
AFPP02771 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
AFPP02771 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
AFPP02771 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFPP02771 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
AFPP02771 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
AFPP02771 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFPP02771 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
AFPP02771 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
AFPP02771 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
AFPP02771 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
AFPP02771 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFPP02771 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
AFPP02771 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFPP02771 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
AFPP02771 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
AFPP02771 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFPP02771 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
AFPP02771 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
AFPP02771 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFPP02771 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFPP02771 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
AFPP02771 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFPP02771 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
AFPP02771 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFPP02771 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFPP02771 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFPP02771 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFPP02771 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
AFPP02771 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
AFPP02771 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
AFPP02771 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
AFPP02771 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFPP02771 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFPP02771 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFPP02771 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFPP02771 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFPP02771 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
AFPP02771 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AFPP02771 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AFPP02771 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AFPP02771 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
AFPP02771 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AFPP02771 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AFPP02771 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
AFPP02771 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AFPP02771 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
AFPP02771 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFPP02771 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFPP02771 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFPP02771 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
AFPP02771 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFPP02771 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFPP02771 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
AFPP02771 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFPP02771 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFPP02771 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFPP02771 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
AFPP02771 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFPP02771 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
AFPP02771 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
AFPP02771 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
AFPP02771 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms