Protein–RNA interactions for Protein: P02655

APOC2, Apolipoprotein C-II, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC2P02655 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
APOC2P02655 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
APOC2P02655 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.54■■■□□ 2
APOC2P02655 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
APOC2P02655 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOC2P02655 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOC2P02655 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOC2P02655 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
APOC2P02655 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
APOC2P02655 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.53■■■□□ 2
APOC2P02655 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
APOC2P02655 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
APOC2P02655 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
APOC2P02655 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOC2P02655 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
APOC2P02655 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOC2P02655 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOC2P02655 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOC2P02655 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
APOC2P02655 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOC2P02655 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
APOC2P02655 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
APOC2P02655 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOC2P02655 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOC2P02655 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOC2P02655 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOC2P02655 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOC2P02655 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOC2P02655 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOC2P02655 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOC2P02655 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOC2P02655 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOC2P02655 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOC2P02655 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOC2P02655 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOC2P02655 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOC2P02655 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOC2P02655 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOC2P02655 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOC2P02655 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOC2P02655 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOC2P02655 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOC2P02655 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOC2P02655 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOC2P02655 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOC2P02655 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOC2P02655 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
APOC2P02655 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOC2P02655 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOC2P02655 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOC2P02655 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOC2P02655 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOC2P02655 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOC2P02655 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOC2P02655 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOC2P02655 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOC2P02655 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOC2P02655 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOC2P02655 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOC2P02655 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
APOC2P02655 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOC2P02655 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
APOC2P02655 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
APOC2P02655 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
APOC2P02655 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOC2P02655 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOC2P02655 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
APOC2P02655 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOC2P02655 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOC2P02655 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOC2P02655 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
APOC2P02655 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
APOC2P02655 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
APOC2P02655 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOC2P02655 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOC2P02655 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOC2P02655 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOC2P02655 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
APOC2P02655 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOC2P02655 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
APOC2P02655 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
APOC2P02655 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
APOC2P02655 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
APOC2P02655 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
APOC2P02655 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOC2P02655 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
APOC2P02655 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOC2P02655 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOC2P02655 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
APOC2P02655 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APOC2P02655 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
APOC2P02655 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
APOC2P02655 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOC2P02655 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOC2P02655 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
APOC2P02655 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOC2P02655 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOC2P02655 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
APOC2P02655 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
APOC2P02655 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.3 ms