Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CFDP00746 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFDP00746 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CFDP00746 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFDP00746 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFDP00746 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFDP00746 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFDP00746 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CFDP00746 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFDP00746 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CFDP00746 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFDP00746 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CFDP00746 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFDP00746 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CFDP00746 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFDP00746 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFDP00746 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CFDP00746 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFDP00746 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFDP00746 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CFDP00746 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFDP00746 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CFDP00746 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CFDP00746 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFDP00746 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CFDP00746 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CFDP00746 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFDP00746 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFDP00746 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFDP00746 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CFDP00746 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFDP00746 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CFDP00746 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFDP00746 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFDP00746 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFDP00746 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CFDP00746 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CFDP00746 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFDP00746 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFDP00746 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFDP00746 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFDP00746 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CFDP00746 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFDP00746 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFDP00746 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFDP00746 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFDP00746 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFDP00746 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFDP00746 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFDP00746 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFDP00746 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFDP00746 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFDP00746 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFDP00746 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFDP00746 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFDP00746 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFDP00746 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFDP00746 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFDP00746 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFDP00746 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFDP00746 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFDP00746 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFDP00746 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFDP00746 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFDP00746 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFDP00746 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFDP00746 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFDP00746 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFDP00746 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFDP00746 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFDP00746 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFDP00746 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFDP00746 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFDP00746 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFDP00746 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFDP00746 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFDP00746 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFDP00746 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFDP00746 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CFDP00746 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFDP00746 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFDP00746 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFDP00746 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CFDP00746 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFDP00746 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFDP00746 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFDP00746 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFDP00746 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CFDP00746 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CFDP00746 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFDP00746 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CFDP00746 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFDP00746 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CFDP00746 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFDP00746 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CFDP00746 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFDP00746 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CFDP00746 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CFDP00746 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CFDP00746 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms