RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421832.2

CTU1-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTU1, Length 2,087 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU1-201ENST00000421832 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.07■■■■■ 6.57
CTU1-201ENST00000421832 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.11■■■■■ 5.45
CTU1-201ENST00000421832 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.01■■■■■ 5.12
CTU1-201ENST00000421832 ABCC9O60706 1549 aa46.94■■■■■ 5.11
CTU1-201ENST00000421832 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.48■■■■■ 5.03
CTU1-201ENST00000421832 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.3■■■■■ 5
CTU1-201ENST00000421832 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.92■■■■■ 4.94
CTU1-201ENST00000421832 NACADO15069 1562 aa45.82■■■■■ 4.93
CTU1-201ENST00000421832 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.56■■■■■ 4.88
CTU1-201ENST00000421832 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.47■■■■■ 4.87
CTU1-201ENST00000421832 SCRIBQ14160 1630 aa45.16■■■■■ 4.82
CTU1-201ENST00000421832 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.78■■■■■ 4.76
CTU1-201ENST00000421832 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.3■■■■■ 4.68
CTU1-201ENST00000421832 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.17■■■■■ 4.66
CTU1-201ENST00000421832 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.68■■■■■ 4.58
CTU1-201ENST00000421832 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
CTU1-201ENST00000421832 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.35■■■■■ 4.53
CTU1-201ENST00000421832 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.32■■■■■ 4.52
CTU1-201ENST00000421832 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.31■■■■■ 4.52
CTU1-201ENST00000421832 SMARCA4P51532 1647 aa43.23■■■■■ 4.51
CTU1-201ENST00000421832 WIZO95785 1651 aa43■■■■■ 4.47
CTU1-201ENST00000421832 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.96■■■■■ 4.47
CTU1-201ENST00000421832 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.69■■■■■ 4.42
CTU1-201ENST00000421832 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.62■■■■■ 4.41
CTU1-201ENST00000421832 SMARCA2P51531 1590 aa42.54■■■■■ 4.4
CTU1-201ENST00000421832 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.47■■■■■ 4.39
CTU1-201ENST00000421832 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
CTU1-201ENST00000421832 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
CTU1-201ENST00000421832 NCAPD3P42695 1498 aa42.31■■■■■ 4.36
CTU1-201ENST00000421832 HMGXB3Q12766 1538 aa42.21■■■■■ 4.35
CTU1-201ENST00000421832 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.05■■■■■ 4.32
CTU1-201ENST00000421832 DNAJC5BQ9UF47 199 aa41.91■■■■■ 4.3
CTU1-201ENST00000421832 CHIC1Q5VXU3 224 aa41.32■■■■■ 4.21
CTU1-201ENST00000421832 CFTRP13569 1480 aa41.25■■■■■ 4.19
CTU1-201ENST00000421832 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.19■■■■■ 4.18
CTU1-201ENST00000421832 NESP48681 1621 aa41.1■■■■■ 4.17
CTU1-201ENST00000421832 ABCC8Q09428 1581 aa41.06■■■■■ 4.16
CTU1-201ENST00000421832 PRDM2Q13029 1718 aa41.06■■■■■ 4.16
CTU1-201ENST00000421832 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.95■■■■■ 4.15
CTU1-201ENST00000421832 TRIM41Q8WV44 630 aa40.84■■■■■ 4.13
CTU1-201ENST00000421832 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.76■■■■■ 4.12
CTU1-201ENST00000421832 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.76■■■■■ 4.12
CTU1-201ENST00000421832 SYNJ1O43426 1573 aa40.69■■■■■ 4.1
CTU1-201ENST00000421832 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.62■■■■■ 4.09
CTU1-201ENST00000421832 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.6■■■■■ 4.09
CTU1-201ENST00000421832 CUX1P39880 1505 aa40.56■■■■■ 4.08
CTU1-201ENST00000421832 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.54■■■■■ 4.08
CTU1-201ENST00000421832 TOP2BQ02880 1626 aa40.51■■■■■ 4.08
CTU1-201ENST00000421832 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.49■■■■■ 4.07
CTU1-201ENST00000421832 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
CTU1-201ENST00000421832 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.3■■■■■ 4.04
CTU1-201ENST00000421832 TOPBP1Q92547 1522 aa40.28■■■■■ 4.04
CTU1-201ENST00000421832 ERCC6Q03468 1493 aa40.23■■■■■ 4.03
CTU1-201ENST00000421832 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.17■■■■■ 4.02
CTU1-201ENST00000421832 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.16■■■■■ 4.02
CTU1-201ENST00000421832 SOGA1O94964 1423 aa40.16■■■■■ 4.02
CTU1-201ENST00000421832 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.15■■■■■ 4.02
CTU1-201ENST00000421832 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.08■■■■■ 4.01
CTU1-201ENST00000421832 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
CTU1-201ENST00000421832 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.04■■■■■ 4
CTU1-201ENST00000421832 WDR62O43379 1518 aa39.99■■■■□ 3.99
CTU1-201ENST00000421832 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.95■■■■□ 3.99
CTU1-201ENST00000421832 EEA1Q15075 1411 aa39.83■■■■□ 3.97
CTU1-201ENST00000421832 CUX2O14529 1486 aa39.8■■■■□ 3.96
CTU1-201ENST00000421832 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa39.78■■■■□ 3.96
CTU1-201ENST00000421832 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.77■■■■□ 3.96
CTU1-201ENST00000421832 WDR97A6NE52 1622 aa39.76■■■■□ 3.96
CTU1-201ENST00000421832 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.75■■■■□ 3.95
CTU1-201ENST00000421832 KIF27Q86VH2 1401 aa39.74■■■■□ 3.95
CTU1-201ENST00000421832 CSRNP3Q8WYN3 585 aa39.72■■■■□ 3.95
CTU1-201ENST00000421832 EHMT2Q96KQ7 1210 aa39.66■■■■□ 3.94
CTU1-201ENST00000421832 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.58■■■■□ 3.93
CTU1-201ENST00000421832 IFT140Q96RY7 1462 aa39.57■■■■□ 3.93
CTU1-201ENST00000421832 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.53■■■■□ 3.92
CTU1-201ENST00000421832 IGF1RP08069 1367 aa39.49■■■■□ 3.91
CTU1-201ENST00000421832 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.48■■■■□ 3.91
CTU1-201ENST00000421832 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.44■■■■□ 3.9
CTU1-201ENST00000421832 KIF21BO75037 1637 aa39.43■■■■□ 3.9
CTU1-201ENST00000421832 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.43■■■■□ 3.9
CTU1-201ENST00000421832 PRXQ9BXM0 1461 aa39.39■■■■□ 3.9
CTU1-201ENST00000421832 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa39.35■■■■□ 3.89
CTU1-201ENST00000421832 GOLGA3Q08378 1498 aa39.33■■■■□ 3.89
CTU1-201ENST00000421832 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.32■■■■□ 3.88
CTU1-201ENST00000421832 PBRM1Q86U86 1689 aa39.31■■■■□ 3.88
CTU1-201ENST00000421832 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.28■■■■□ 3.88
CTU1-201ENST00000421832 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.26■■■■□ 3.87
CTU1-201ENST00000421832 CUL7Q14999 1698 aa39.21■■■■□ 3.87
CTU1-201ENST00000421832 GRIN2BQ13224 1484 aa39.19■■■■□ 3.86
CTU1-201ENST00000421832 UBTFP17480 764 aaKnown RBP39.18■■■■□ 3.86
CTU1-201ENST00000421832 HRCP23327 699 aa39.17■■■■□ 3.86
CTU1-201ENST00000421832 TNIKQ9UKE5 1360 aa39.1■■■■□ 3.85
CTU1-201ENST00000421832 ADAMTS12P58397 1594 aa39.05■■■■□ 3.84
CTU1-201ENST00000421832 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.03■■■■□ 3.84
CTU1-201ENST00000421832 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.98■■■■□ 3.83
CTU1-201ENST00000421832 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.91■■■■□ 3.82
CTU1-201ENST00000421832 CEP162Q5TB80 1403 aa38.9■■■■□ 3.82
CTU1-201ENST00000421832 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
CTU1-201ENST00000421832 SYNJ2O15056 1496 aa38.77■■■■□ 3.8
CTU1-201ENST00000421832 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa38.76■■■■□ 3.79
CTU1-201ENST00000421832 GRIN2AQ12879 1464 aa38.74■■■■□ 3.79
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