RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356990.9

RNF19B-202, Transcript of ring finger protein 19B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF19B, Length 2,598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19B-202ENST00000356990 NISCHQ9Y2I1 1504 aa47.34■■■■■ 5.17
RNF19B-202ENST00000356990 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.6■■■■■ 4.09
RNF19B-202ENST00000356990 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.16■■■■■ 4.02
RNF19B-202ENST00000356990 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4
RNF19B-202ENST00000356990 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.01■■■■□ 3.99
RNF19B-202ENST00000356990 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.59■■■■□ 3.93
RNF19B-202ENST00000356990 HRCP23327 699 aa39.4■■■■□ 3.9
RNF19B-202ENST00000356990 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.34■■■■□ 3.89
RNF19B-202ENST00000356990 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.24■■■■□ 3.87
RNF19B-202ENST00000356990 PCGF6Q9BYE7 350 aa38.94■■■■□ 3.82
RNF19B-202ENST00000356990 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.66■■■■□ 3.78
RNF19B-202ENST00000356990 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP38.65■■■■□ 3.78
RNF19B-202ENST00000356990 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.26■■■■□ 3.72
RNF19B-202ENST00000356990 SCRIBQ14160 1630 aa37.91■■■■□ 3.66
RNF19B-202ENST00000356990 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP37.87■■■■□ 3.65
RNF19B-202ENST00000356990 ABCC9O60706 1549 aa37.73■■■■□ 3.63
RNF19B-202ENST00000356990 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.48■■■■□ 3.59
RNF19B-202ENST00000356990 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
RNF19B-202ENST00000356990 NACADO15069 1562 aa37.18■■■■□ 3.54
RNF19B-202ENST00000356990 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.15■■■■□ 3.54
RNF19B-202ENST00000356990 TRIM41Q8WV44 630 aa37.14■■■■□ 3.54
RNF19B-202ENST00000356990 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.1■■■■□ 3.53
RNF19B-202ENST00000356990 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.04■■■■□ 3.52
RNF19B-202ENST00000356990 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.9■■■■□ 3.5
RNF19B-202ENST00000356990 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
RNF19B-202ENST00000356990 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
RNF19B-202ENST00000356990 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.84■■■■□ 3.49
RNF19B-202ENST00000356990 WIZO95785 1651 aa36.73■■■■□ 3.47
RNF19B-202ENST00000356990 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
RNF19B-202ENST00000356990 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.33■■■■□ 3.41
RNF19B-202ENST00000356990 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.26■■■■□ 3.4
RNF19B-202ENST00000356990 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.22■■■■□ 3.39
RNF19B-202ENST00000356990 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
RNF19B-202ENST00000356990 NEUROD1Q13562 356 aa36.15■■■■□ 3.38
RNF19B-202ENST00000356990 SMARCA4P51532 1647 aa36.1■■■■□ 3.37
RNF19B-202ENST00000356990 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.07■■■■□ 3.36
RNF19B-202ENST00000356990 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP36.05■■■■□ 3.36
RNF19B-202ENST00000356990 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36■■■■□ 3.35
RNF19B-202ENST00000356990 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP35.96■■■■□ 3.35
RNF19B-202ENST00000356990 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.94■■■■□ 3.34
RNF19B-202ENST00000356990 ABCC8Q09428 1581 aa35.92■■■■□ 3.34
RNF19B-202ENST00000356990 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa35.86■■■■□ 3.33
RNF19B-202ENST00000356990 SMARCA2P51531 1590 aa35.86■■■■□ 3.33
RNF19B-202ENST00000356990 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
RNF19B-202ENST00000356990 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.79■■■■□ 3.32
RNF19B-202ENST00000356990 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
RNF19B-202ENST00000356990 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.68■■■■□ 3.3
RNF19B-202ENST00000356990 CEP162Q5TB80 1403 aa35.59■■■■□ 3.29
RNF19B-202ENST00000356990 SOGA1O94964 1423 aa35.54■■■■□ 3.28
RNF19B-202ENST00000356990 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
RNF19B-202ENST00000356990 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.42■■■■□ 3.26
RNF19B-202ENST00000356990 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.42■■■■□ 3.26
RNF19B-202ENST00000356990 UBTFP17480 764 aaKnown RBP35.3■■■■□ 3.24
RNF19B-202ENST00000356990 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.29■■■■□ 3.24
RNF19B-202ENST00000356990 CSRNP3Q8WYN3 585 aa35.28■■■■□ 3.24
RNF19B-202ENST00000356990 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP35.27■■■■□ 3.24
RNF19B-202ENST00000356990 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.21■■■■□ 3.23
RNF19B-202ENST00000356990 MYT1Q01538 1121 aa35.16■■■■□ 3.22
RNF19B-202ENST00000356990 EEA1Q15075 1411 aa35.15■■■■□ 3.22
RNF19B-202ENST00000356990 MIER1Q8N108 512 aa35.13■■■■□ 3.21
RNF19B-202ENST00000356990 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
RNF19B-202ENST00000356990 SYNJ1O43426 1573 aa35.09■■■■□ 3.21
RNF19B-202ENST00000356990 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.2
RNF19B-202ENST00000356990 GOLGA3Q08378 1498 aa35.05■■■■□ 3.2
RNF19B-202ENST00000356990 CLIP1P30622 1438 aa34.75■■■■□ 3.15
RNF19B-202ENST00000356990 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.75■■■■□ 3.15
RNF19B-202ENST00000356990 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.72■■■■□ 3.15
RNF19B-202ENST00000356990 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.66■■■■□ 3.14
RNF19B-202ENST00000356990 KIF21BO75037 1637 aa34.65■■■■□ 3.14
RNF19B-202ENST00000356990 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa34.64■■■■□ 3.14
RNF19B-202ENST00000356990 APLP2Q06481 763 aa34.61■■■■□ 3.13
RNF19B-202ENST00000356990 TOP2BQ02880 1626 aa34.56■■■■□ 3.12
RNF19B-202ENST00000356990 NCAPD3P42695 1498 aa34.46■■■■□ 3.11
RNF19B-202ENST00000356990 HMGXB3Q12766 1538 aa34.41■■■■□ 3.1
RNF19B-202ENST00000356990 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.41■■■■□ 3.1
RNF19B-202ENST00000356990 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
RNF19B-202ENST00000356990 CUX1P39880 1505 aa34.34■■■■□ 3.09
RNF19B-202ENST00000356990 CLSPNQ9HAW4 1339 aa34.32■■■■□ 3.09
RNF19B-202ENST00000356990 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
RNF19B-202ENST00000356990 CFTRP13569 1480 aa34.2■■■■□ 3.07
RNF19B-202ENST00000356990 PRXQ9BXM0 1461 aa34.2■■■■□ 3.07
RNF19B-202ENST00000356990 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.18■■■■□ 3.06
RNF19B-202ENST00000356990 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.09■■■■□ 3.05
RNF19B-202ENST00000356990 ARAP1Q96P48 1450 aa34.09■■■■□ 3.05
RNF19B-202ENST00000356990 KIF27Q86VH2 1401 aa34.06■■■■□ 3.04
RNF19B-202ENST00000356990 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa33.99■■■■□ 3.03
RNF19B-202ENST00000356990 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP33.97■■■■□ 3.03
RNF19B-202ENST00000356990 KCNH8Q96L42 1107 aa33.92■■■■□ 3.02
RNF19B-202ENST00000356990 CUX2O14529 1486 aa33.86■■■■□ 3.01
RNF19B-202ENST00000356990 ITGAEP38570 1179 aa33.86■■■■□ 3.01
RNF19B-202ENST00000356990 CADPSQ9ULU8 1353 aa33.86■■■■□ 3.01
RNF19B-202ENST00000356990 PRDM2Q13029 1718 aa33.84■■■■□ 3.01
RNF19B-202ENST00000356990 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.83■■■■□ 3.01
RNF19B-202ENST00000356990 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.8■■■■□ 3
RNF19B-202ENST00000356990 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.79■■■■□ 3
RNF19B-202ENST00000356990 IGF1RP08069 1367 aa33.77■■■■□ 3
RNF19B-202ENST00000356990 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.74■■■□□ 2.99
RNF19B-202ENST00000356990 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa33.69■■■□□ 2.98
RNF19B-202ENST00000356990 ANP32EQ9BTT0 268 aa33.68■■■□□ 2.98
RNF19B-202ENST00000356990 BCANQ96GW7 911 aa33.67■■■□□ 2.98
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