Protein–RNA interactions for Protein: O95970

LGI1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI1O95970 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGI1O95970 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LGI1O95970 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGI1O95970 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LGI1O95970 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LGI1O95970 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGI1O95970 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LGI1O95970 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LGI1O95970 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
LGI1O95970 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGI1O95970 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGI1O95970 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LGI1O95970 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGI1O95970 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGI1O95970 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LGI1O95970 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LGI1O95970 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LGI1O95970 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGI1O95970 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LGI1O95970 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGI1O95970 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGI1O95970 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGI1O95970 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LGI1O95970 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
LGI1O95970 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
LGI1O95970 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGI1O95970 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LGI1O95970 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LGI1O95970 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGI1O95970 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LGI1O95970 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LGI1O95970 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGI1O95970 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGI1O95970 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGI1O95970 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LGI1O95970 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGI1O95970 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGI1O95970 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGI1O95970 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGI1O95970 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGI1O95970 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LGI1O95970 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LGI1O95970 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LGI1O95970 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGI1O95970 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGI1O95970 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LGI1O95970 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGI1O95970 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGI1O95970 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGI1O95970 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LGI1O95970 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGI1O95970 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LGI1O95970 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGI1O95970 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LGI1O95970 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LGI1O95970 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGI1O95970 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGI1O95970 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LGI1O95970 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGI1O95970 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LGI1O95970 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LGI1O95970 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGI1O95970 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGI1O95970 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LGI1O95970 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGI1O95970 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LGI1O95970 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LGI1O95970 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGI1O95970 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LGI1O95970 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGI1O95970 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LGI1O95970 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGI1O95970 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGI1O95970 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LGI1O95970 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGI1O95970 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGI1O95970 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LGI1O95970 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LGI1O95970 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LGI1O95970 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LGI1O95970 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGI1O95970 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGI1O95970 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGI1O95970 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LGI1O95970 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI1O95970 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI1O95970 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI1O95970 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI1O95970 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI1O95970 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LGI1O95970 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI1O95970 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI1O95970 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI1O95970 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI1O95970 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI1O95970 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI1O95970 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI1O95970 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LGI1O95970 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LGI1O95970 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms