Protein–RNA interactions for Protein: O75131

CPNE3, Copine-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE3O75131 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CPNE3O75131 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CPNE3O75131 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CPNE3O75131 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CPNE3O75131 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPNE3O75131 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CPNE3O75131 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CPNE3O75131 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms