Protein–RNA interactions for Protein: O00541

PES1, Pescadillo homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PES1O00541 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PES1O00541 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PES1O00541 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PES1O00541 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PES1O00541 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PES1O00541 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PES1O00541 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PES1O00541 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PES1O00541 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
PES1O00541 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PES1O00541 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PES1O00541 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PES1O00541 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PES1O00541 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PES1O00541 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PES1O00541 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PES1O00541 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PES1O00541 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PES1O00541 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PES1O00541 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PES1O00541 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PES1O00541 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PES1O00541 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PES1O00541 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PES1O00541 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PES1O00541 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PES1O00541 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
PES1O00541 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PES1O00541 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PES1O00541 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PES1O00541 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PES1O00541 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PES1O00541 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PES1O00541 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PES1O00541 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PES1O00541 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PES1O00541 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PES1O00541 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PES1O00541 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PES1O00541 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PES1O00541 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PES1O00541 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PES1O00541 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PES1O00541 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PES1O00541 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PES1O00541 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PES1O00541 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PES1O00541 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PES1O00541 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PES1O00541 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PES1O00541 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PES1O00541 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PES1O00541 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PES1O00541 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PES1O00541 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PES1O00541 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PES1O00541 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PES1O00541 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PES1O00541 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PES1O00541 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PES1O00541 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PES1O00541 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PES1O00541 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PES1O00541 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PES1O00541 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PES1O00541 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PES1O00541 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PES1O00541 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PES1O00541 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PES1O00541 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PES1O00541 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PES1O00541 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PES1O00541 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PES1O00541 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PES1O00541 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PES1O00541 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PES1O00541 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PES1O00541 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PES1O00541 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PES1O00541 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PES1O00541 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PES1O00541 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PES1O00541 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PES1O00541 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PES1O00541 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PES1O00541 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PES1O00541 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PES1O00541 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PES1O00541 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PES1O00541 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PES1O00541 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PES1O00541 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PES1O00541 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PES1O00541 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PES1O00541 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PES1O00541 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PES1O00541 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PES1O00541 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PES1O00541 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PES1O00541 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms