Protein–RNA interactions for Protein: O00322

UPK1A, Uroplakin-1a, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK1AO00322 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UPK1AO00322 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UPK1AO00322 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
UPK1AO00322 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
UPK1AO00322 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UPK1AO00322 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
UPK1AO00322 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
UPK1AO00322 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms