Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CLDN34H7C241 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLDN34H7C241 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLDN34H7C241 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN34H7C241 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLDN34H7C241 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLDN34H7C241 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms