Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLDN34H7C241 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLDN34H7C241 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLDN34H7C241 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CLDN34H7C241 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CLDN34H7C241 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CLDN34H7C241 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLDN34H7C241 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN34H7C241 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CLDN34H7C241 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
CLDN34H7C241 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN34H7C241 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN34H7C241 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN34H7C241 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLDN34H7C241 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN34H7C241 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN34H7C241 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN34H7C241 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN34H7C241 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN34H7C241 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN34H7C241 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN34H7C241 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CLDN34H7C241 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CLDN34H7C241 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN34H7C241 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CLDN34H7C241 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN34H7C241 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CLDN34H7C241 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLDN34H7C241 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLDN34H7C241 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN34H7C241 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN34H7C241 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN34H7C241 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN34H7C241 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN34H7C241 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLDN34H7C241 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLDN34H7C241 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN34H7C241 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLDN34H7C241 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CLDN34H7C241 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CLDN34H7C241 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CLDN34H7C241 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CLDN34H7C241 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLDN34H7C241 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLDN34H7C241 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLDN34H7C241 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLDN34H7C241 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN34H7C241 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLDN34H7C241 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN34H7C241 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN34H7C241 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN34H7C241 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN34H7C241 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN34H7C241 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN34H7C241 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN34H7C241 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN34H7C241 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN34H7C241 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN34H7C241 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN34H7C241 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN34H7C241 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLDN34H7C241 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN34H7C241 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN34H7C241 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLDN34H7C241 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN34H7C241 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN34H7C241 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLDN34H7C241 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN34H7C241 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CLDN34H7C241 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN34H7C241 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN34H7C241 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN34H7C241 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN34H7C241 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN34H7C241 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN34H7C241 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN34H7C241 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN34H7C241 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN34H7C241 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN34H7C241 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN34H7C241 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN34H7C241 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN34H7C241 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN34H7C241 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN34H7C241 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN34H7C241 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN34H7C241 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CLDN34H7C241 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN34H7C241 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN34H7C241 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CLDN34H7C241 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLDN34H7C241 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN34H7C241 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLDN34H7C241 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN34H7C241 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLDN34H7C241 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN34H7C241 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN34H7C241 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLDN34H7C241 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLDN34H7C241 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms