Protein–RNA interactions for Protein: A0ZSE6

TMEM30CP, Cell cycle control protein 50C, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CPA0ZSE6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM30CPA0ZSE6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMEM30CPA0ZSE6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TMEM30CPA0ZSE6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30CPA0ZSE6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM30CPA0ZSE6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30CPA0ZSE6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30CPA0ZSE6 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30CPA0ZSE6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30CPA0ZSE6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM30CPA0ZSE6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30CPA0ZSE6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30CPA0ZSE6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30CPA0ZSE6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM30CPA0ZSE6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms