Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WUJ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WUJ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
A0A087WUJ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WUJ7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WUJ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WUJ7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WUJ7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
A0A087WUJ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
A0A087WUJ7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
A0A087WUJ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
A0A087WUJ7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
A0A087WUJ7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
A0A087WUJ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms