Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTP11Q9Y3A2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTP11Q9Y3A2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UTP11Q9Y3A2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTP11Q9Y3A2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTP11Q9Y3A2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UTP11Q9Y3A2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UTP11Q9Y3A2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UTP11Q9Y3A2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UTP11Q9Y3A2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
UTP11Q9Y3A2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UTP11Q9Y3A2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UTP11Q9Y3A2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UTP11Q9Y3A2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UTP11Q9Y3A2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTP11Q9Y3A2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UTP11Q9Y3A2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UTP11Q9Y3A2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
UTP11Q9Y3A2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
UTP11Q9Y3A2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UTP11Q9Y3A2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UTP11Q9Y3A2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
UTP11Q9Y3A2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTP11Q9Y3A2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UTP11Q9Y3A2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
UTP11Q9Y3A2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTP11Q9Y3A2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UTP11Q9Y3A2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms