Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK0

GRID1, Glutamate receptor ionotropic, delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID1Q9ULK0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GRID1Q9ULK0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRID1Q9ULK0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRID1Q9ULK0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRID1Q9ULK0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRID1Q9ULK0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRID1Q9ULK0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRID1Q9ULK0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRID1Q9ULK0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRID1Q9ULK0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRID1Q9ULK0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRID1Q9ULK0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GRID1Q9ULK0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRID1Q9ULK0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRID1Q9ULK0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRID1Q9ULK0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GRID1Q9ULK0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GRID1Q9ULK0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms