Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RABGEF1Q9UJ41 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RABGEF1Q9UJ41 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RABGEF1Q9UJ41 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RABGEF1Q9UJ41 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RABGEF1Q9UJ41 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RABGEF1Q9UJ41 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RABGEF1Q9UJ41 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RABGEF1Q9UJ41 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RABGEF1Q9UJ41 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
RABGEF1Q9UJ41 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
RABGEF1Q9UJ41 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms