Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CGGBP1Q9UFW8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CGGBP1Q9UFW8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CGGBP1Q9UFW8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CGGBP1Q9UFW8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CGGBP1Q9UFW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGGBP1Q9UFW8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CGGBP1Q9UFW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CGGBP1Q9UFW8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CGGBP1Q9UFW8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CGGBP1Q9UFW8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGGBP1Q9UFW8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGGBP1Q9UFW8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGGBP1Q9UFW8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGGBP1Q9UFW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGGBP1Q9UFW8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CGGBP1Q9UFW8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGGBP1Q9UFW8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CGGBP1Q9UFW8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CGGBP1Q9UFW8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CGGBP1Q9UFW8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CGGBP1Q9UFW8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CGGBP1Q9UFW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
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