Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RCC2Q9P258 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCC2Q9P258 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCC2Q9P258 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RCC2Q9P258 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RCC2Q9P258 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RCC2Q9P258 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RCC2Q9P258 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCC2Q9P258 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCC2Q9P258 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RCC2Q9P258 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RCC2Q9P258 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RCC2Q9P258 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCC2Q9P258 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RCC2Q9P258 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCC2Q9P258 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCC2Q9P258 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCC2Q9P258 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCC2Q9P258 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RCC2Q9P258 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RCC2Q9P258 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RCC2Q9P258 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RCC2Q9P258 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RCC2Q9P258 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms