Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF5

FAM13B, Protein FAM13B, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13BQ9NYF5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
FAM13BQ9NYF5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
FAM13BQ9NYF5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
FAM13BQ9NYF5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
FAM13BQ9NYF5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FAM13BQ9NYF5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
FAM13BQ9NYF5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
FAM13BQ9NYF5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
FAM13BQ9NYF5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
FAM13BQ9NYF5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
FAM13BQ9NYF5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FAM13BQ9NYF5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
FAM13BQ9NYF5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
FAM13BQ9NYF5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FAM13BQ9NYF5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
FAM13BQ9NYF5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
FAM13BQ9NYF5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FAM13BQ9NYF5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FAM13BQ9NYF5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FAM13BQ9NYF5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FAM13BQ9NYF5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FAM13BQ9NYF5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FAM13BQ9NYF5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FAM13BQ9NYF5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FAM13BQ9NYF5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FAM13BQ9NYF5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FAM13BQ9NYF5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
FAM13BQ9NYF5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FAM13BQ9NYF5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FAM13BQ9NYF5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
FAM13BQ9NYF5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FAM13BQ9NYF5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FAM13BQ9NYF5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
FAM13BQ9NYF5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms